Храм в селе Михайловское был основан в 1701 году иноками Ипатьевского монастыря. В 1819 году на средства прихожан построен каменный храм с колокольней. Более 200 лет в храме не прекращаются богослужения, без настоятеля храм остался лишь на несколько лет в конце Великой Отечественной войны .

С 1955 по 1972 здесь служил преподобный Леонтий, архимандрит Михайловский, претерпевший неоднократные гонения советской власти и в последние годы жизни ставший благодатным старцем. Недалеко от храма - святой источник, открывшийся по молитвам преподобного.

Уникальная святыня храма - мощи Леонтия Михайловского.